[БендеровецЪ]

кол-во данных должно сохраняться, т.е. из 1024х отсчетов получаем 1024 Фурье-координаты, половина из которых - синусы, половина - косинусы

Получаеш 1024 комплексных числа, половина из которых для отрицательных частот. Просто они будут зеркально симетричны относительно fs/2 или 0Hz.