[begemot]

нет степпинга номинала элемента, накопления графиков

Как нет? Добавляете на схему команду .STEP и всё степается и выводит все графики.

Очень не нравится, что после каждого изменения в схеме нужно опять нажимать на кнопку "симуль"

нельзя на ходу смотреть передаточные функции и переходные процессы меняя номиналы и элементы в схеме

Если что-то меняется-схема должна пересчитываться. Как иначе?

переключаясь с Transeint на AC Analysis не запоминаются последние данные

А в чём проблема сохранить?

Так нет модели источника напряжения с разными переключаемыми на лету видами сигналов

Что значит на лету? Выбираете источник и в меню изменяете тип сигнала и параметры.
В МС насколько я помню Вы так же меняете параметры в табличке меню. Причём в ЛТ
эти параметры видны на схеме по умолчанию. В МС-наоборот.
Тут один МС "мастерклоун" недавно жидко обо...я в связи с тем что не понимал что именно он делает.
Но вообще, оба вполне пристойные симуляторы, надо просто адекватно их использовать
Одна из причин-не смотрел что установлено в источниках

Интерфейс ЛТ конечно немного аскетичен. К этому надо привыкнуть, но особой проблемы это не представляет.
МС не показывает многое из того что делает за кадром. И многие вещи удобно введены в интерфейс.
Но в результате, не всегда понятно что именно и как он делает.
Например, когда он выводит гармоники-он пользуется Сайсовской командой .FOUR. Просто это введено в UI.
Но поскольку в .FOUR анализируется последний период, желательно задавать время после которого можно начинать анализ.
А в МС по умолчанию это не очевидно. Нажимаешь кнопочку, считается быстро, создаётся иллюзия что можно что-то
сделать не понимая как именно это делается. Что приводит к ошибкам и неточности моделирования